Общество с ограниченной ответственностью  «Управляющая компания «БФА» начало свою деятельность летом 2002 года в рамках обособленной бизнес единицы Промышленно-строительного банка. Основной задачей, стоящей перед Управляющей компанией ПСБ, являлось предоставление услуг по доверительному управлению средствами физических и юридических лиц. В 2007 году произошла смена состава участников Общества – доля ОАО «ВТБ Северо-Запад» была выкуплена ЗАО «Группа БФА». В мае 2008 года состоялся ребрендинг УК ПСБ, и компания была переименована в Управляющую компанию БФА. В это же время, УК БФА пополнила список компаний стратегических партнеров под единым брендом, в число которых входят Инвестиционная компания БФА (ЗАО «БФА») и ОАО «Банк БФА».  

Стремясь активно завоевывать новые рынки, в конце 2007 года УК БФА получила в доверительное управление средства одного из первых в России эндаумент-фондов, «Фонд развития ВШМ СПбГУ», а в 2011 году стала управляющей компанией эндаумент-фонда «Фонд поддержки и развития Санкт-Петербургского государственного университета экономики и финансов». В декабре 2012 года компания начала управлять средствами «Специализированного фонда управления целевым капиталом Развитие Северо-Западного института РАНХиГС».